ID | 103717 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Smox | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027333 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | spermine oxidase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | SMO, B130066H01Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.330) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01678 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 131333624-131367103 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 131353979 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Histidine at position 17 (R17H) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000114956 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000028806] [ENSMUST00000110179] [ENSMUST00000110180] [ENSMUST00000110181] [ENSMUST00000110182] [ENSMUST00000110183] [ENSMUST00000110186] [ENSMUST00000110188] [ENSMUST00000183947] [ENSMUST00000110189] [ENSMUST00000131698] [ENSMUST00000183575] [ENSMUST00000129143] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99K82 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000028806 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000028806 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110179 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105808 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110180 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105809 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000110181 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.204 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105810 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110182 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105811 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110183 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105812 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110186 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105815 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110188 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105817 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000183947 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139278 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000110189 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.550 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000105818 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000131698 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.906 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114956 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000183575 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.629 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139099 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129143 AA Change: R17H PolyPhen 2 Score 0.180 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120237 Gene: ENSMUSG00000027333 AA Change: R17H
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149180 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151627 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Polyamines are ubiquitous polycationic alkylamines which include spermine, spermidine, putrescine, and agmatine. These molecules participate in a broad range of cellular functions which include cell cycle modulation, scavenging reactive oxygen species, and the control of gene expression. These molecules also play important roles in neurotransmission through their regulation of cell-surface receptor activity, involvement in intracellular signalling pathways, and their putative roles as neurotransmitters. This gene encodes an FAD-containing enzyme that catalyzes the oxidation of spermine to spermadine and secondarily produces hydrogen peroxide. Multiple transcript variants encoding different isoenzymes have been identified for this gene, some of which have failed to demonstrate significant oxidase activity on natural polyamine substrates. The characterized isoenzymes have distinctive biochemical characteristics and substrate specificities, suggesting the existence of additional levels of complexity in polyamine catabolism. [provided by RefSeq, Jul 2012] PHENOTYPE: No notable phenotype was detected in a high-throughput screen of homozygous mice. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Smox |
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Posted On | 2014-01-21 |