ID | 11442 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Il36a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026984 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interleukin 36A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Fil1epsilon, IL-1H1, If36a, Il1f6, Fil1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.060) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00869 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 24105429-24115713 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 24106592 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Alanine at position 59 (T59A) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000028361 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000028361] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JLA2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000028361 AA Change: T59A PolyPhen 2 Score 0.209 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000028361 Gene: ENSMUSG00000026984 AA Change: T59A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144442 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene is a cytokine that can activate NF-kappa-B and MAPK signaling pathways to generate an inflammatory response. The encoded protein functions primarily in skin and demonstrates increased expression in psoriasis. In addition, decreased expression of this gene has been linked to a poor prognosis in both hepatocellular carcinoma and colorectal cancer patients. [provided by RefSeq, Nov 2015] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Il36a |
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Posted On | 2012-12-06 |