ID | 14230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spsb3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024160 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3300001M01Rik, SSB3, 2310012N15Rik, Tce1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.131) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 25105617-25111126 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 25109539 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000126878 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000024976] [ENSMUST00000043907] [ENSMUST00000044252] [ENSMUST00000068508] [ENSMUST00000117890] [ENSMUST00000119829] [ENSMUST00000119848] [ENSMUST00000120943] [ENSMUST00000130194] [ENSMUST00000144430] [ENSMUST00000121542] [ENSMUST00000139754] [ENSMUST00000146923] [ENSMUST00000154236] [ENSMUST00000168265] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q571F5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000024976 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000024976 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000043907 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000045111 Gene: ENSMUSG00000038880
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000044252 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000049319 Gene: ENSMUSG00000039183
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000068508 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000068567 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000117890 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112380 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119829 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112589 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119848 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113167 Gene: ENSMUSG00000073436
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120943 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112492 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000130194 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119896 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134932 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145882 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000138648 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127293 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128953 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156659 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140688 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144430 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117226 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000121542 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113936 Gene: ENSMUSG00000073436
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139754 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118245 Gene: ENSMUSG00000073436
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000146923 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114802 Gene: ENSMUSG00000024163
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154236 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120985 Gene: ENSMUSG00000038880
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168265 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126878 Gene: ENSMUSG00000024160
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Spsb3 |
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Posted On | 2012-12-06 |