ID | 14949 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zscan26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger and SCAN domain containing 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Zfp187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.145) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00720 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 21626350-21637900 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 21629369 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Histidine at position 378 (R378H) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000106111 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032820] [ENSMUST00000099719] [ENSMUST00000110485] [ENSMUST00000122872] [ENSMUST00000145494] [ENSMUST00000151743] [ENSMUST00000148071] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q5RJ54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032820 AA Change: R252H PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032820 Gene: ENSMUSG00000022228 AA Change: R252H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000099719 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000097307 Gene: ENSMUSG00000055313
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000110485 AA Change: R378H PolyPhen 2 Score 0.001 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.15) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106111 Gene: ENSMUSG00000022228 AA Change: R378H
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000122641 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122872 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120175 Gene: ENSMUSG00000055313
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000122926 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000145494 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118503 Gene: ENSMUSG00000055313
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000151743 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117669 Gene: ENSMUSG00000055313
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000148071 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114882 Gene: ENSMUSG00000055313
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zscan26 |
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Posted On | 2012-12-06 |