ID | 150798 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Spsb3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000024160 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3300001M01Rik, SSB3, 2310012N15Rik, Tce1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039357-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.106) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1291 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 25105617-25111126 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 25106782 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000049319 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000024976] [ENSMUST00000044252] [ENSMUST00000068508] [ENSMUST00000117890] [ENSMUST00000119829] [ENSMUST00000119848] [ENSMUST00000120943] [ENSMUST00000168265] [ENSMUST00000130194] [ENSMUST00000121542] [ENSMUST00000146923] [ENSMUST00000144430] [ENSMUST00000139754] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q571F5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000024976 AA Change: R41L PolyPhen 2 Score 0.958 (Sensitivity: 0.78; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000024976 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R41L
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000044252 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000049319 Gene: ENSMUSG00000039183
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000068508 AA Change: R6L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000068567 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R6L
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000117890 AA Change: R6L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112380 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R6L
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000119829 AA Change: R6L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112589 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R6L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119848 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113167 Gene: ENSMUSG00000073436
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000120943 AA Change: R6L PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112492 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R6L
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000168265 AA Change: R152L PolyPhen 2 Score 0.930 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126878 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R152L
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000130194 AA Change: R6L PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119896 Gene: ENSMUSG00000024160 AA Change: R6L
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145882 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134932 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156659 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000121542 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113936 Gene: ENSMUSG00000073436
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000146923 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114802 Gene: ENSMUSG00000024163
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144430 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117226 Gene: ENSMUSG00000024160
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139754 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118245 Gene: ENSMUSG00000073436
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Spsb3 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GGATGCCATTTGCCAAAGTGGAC -3' (R):5'- AGACACTGGTTATCCCCACCTTGC -3' Sequencing Primer (F):5'- cgcggaggaggagcaag -3' (R):5'- GCCACTTCGACCTACCTG -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |