ID | 151615 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Syt6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027849 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | synaptotagmin VI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3110037A08Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039329-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.123) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1262 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 220 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 103482561-103552883 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice acceptor site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 103492656 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000138874 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000090697] [ENSMUST00000090697] [ENSMUST00000090697] [ENSMUST00000117221] [ENSMUST00000118117] [ENSMUST00000118563] [ENSMUST00000118563] [ENSMUST00000118563] [ENSMUST00000121834] [ENSMUST00000121834] [ENSMUST00000121834] [ENSMUST00000132325] [ENSMUST00000136049] [ENSMUST00000183637] [ENSMUST00000183637] [ENSMUST00000183637] [ENSMUST00000151985] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9R0N8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000090697 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088196 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000090697 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088196 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000090697 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000088196 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000117221 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113373 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000118117 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112486 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000118563 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113287 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000118563 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113287 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000118563 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113287 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121834 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112997 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121834 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112997 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000121834 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112997 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000132325 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116324 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000136049 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118124 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000183637 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138874 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000183637 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138874 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000183637 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138874 Gene: ENSMUSG00000027849
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000151985 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene belongs to the synaptotagmin family. Synaptotagmins share a common domain structure that includes a transmembrane domain and a cytoplasmic region composed of 2 C2 domains, and are involved in calcium-dependent exocytosis of synaptic vesicles. This protein has been shown to be a key component of the secretory machinery involved in acrosomal exocytosis. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Syt6 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AAACCGTAGCTTCTTCCCGTGAC -3' (R):5'- GCGCATGATGTGCTCTTTGACC -3' Sequencing Primer (F):5'- GACTTGGTAGCTTTGCTCATAAC -3' (R):5'- AAGTGTGGCTGATCTTCACAG -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |