ID | 154370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Babam2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000052139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | BRISC and BRCA1 A complex member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | B830038C02Rik, 6030405P19Rik, Bre | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.678) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 31855394-32242083 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 31859442 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Alanine to Valine at position 3 (A3V) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000110152 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000031018] [ENSMUST00000063813] [ENSMUST00000071531] [ENSMUST00000114507] [ENSMUST00000114515] [ENSMUST00000131995] [ENSMUST00000201352] [ENSMUST00000202293] [ENSMUST00000202815] [ENSMUST00000200705] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8K3W0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031018 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031018 Gene: ENSMUSG00000029136
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000063813 AA Change: A49V |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000069133 Gene: ENSMUSG00000052139 AA Change: A49V
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000071531 AA Change: A3V |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000071462 Gene: ENSMUSG00000052139 AA Change: A3V
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000114507 AA Change: A3V PolyPhen 2 Score 0.904 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110152 Gene: ENSMUSG00000052139 AA Change: A3V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114515 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110160 Gene: ENSMUSG00000052139
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131995 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128351 Gene: ENSMUSG00000052139
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000200694 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202033 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201202 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201592 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201107 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201487 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201352 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144205 Gene: ENSMUSG00000052139
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202293 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202815 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144497 Gene: ENSMUSG00000052139
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200705 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143964 Gene: ENSMUSG00000052139
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes an anti-apoptotic, death receptor-associated protein that interacts with tumor necrosis factor-receptor-1. The encoded protein acts as an adapter in several protein complexes, including the BRCA1-A complex and the BRISC complex. The BRCA1-A complex possesses ubiquitinase activity and targets sites of double strand DNA breaks, while the BRISC complex exhibits deubiquitinase activity and is involved in mitotic spindle assembly. This gene is upregulated in several types of cancer. [provided by RefSeq, Jun 2016] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele are fertile. However, fibroblasts exhibit decreased proliferation and increased cellular replicative senescence in response to irradiation and hydrogen peroxide with impaired DNA damage repair. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Babam2 |
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Posted On | 2014-02-04 |