ID | 157278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Acp4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000012777 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | acid phosphatase 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Acpt, EG546967 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039394-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.094) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1328 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 43901572-43906802 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site (5 bp from exon) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 43906516 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000112922 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000012921] [ENSMUST00000012921] [ENSMUST00000055858] [ENSMUST00000071296] [ENSMUST00000084937] [ENSMUST00000107945] [ENSMUST00000107945] [ENSMUST00000107948] [ENSMUST00000107949] [ENSMUST00000118216] [ENSMUST00000118216] [ENSMUST00000124863] [ENSMUST00000107950] [ENSMUST00000188111] [ENSMUST00000188382] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | D3YTS9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000012921 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000012921 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000012921 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000012921 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000055858 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103583 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000071296 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000071265 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000084937 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000095894 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107945 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103578 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000107945 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103578 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107948 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103581 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107949 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103582 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000118216 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112922 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000118216 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112922 Gene: ENSMUSG00000012777
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000187314 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125318 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137742 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147088 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000124863 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107950 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103584 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000188111 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139694 Gene: ENSMUSG00000045411
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000188382 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140200 Gene: ENSMUSG00000045411
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Meta Mutation Damage Score | 0.9755 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (37/37) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Acid phosphatases are enzymes capable of hydrolyzing orthophosphoric acid esters in an acid medium. This gene is up-regulated by androgens and is down-regulated by estrogens in the prostate cancer cell line. This gene exhibits a lower level of expression in testicular cancer tissues than in normal tissues. The protein encoded by this gene has structural similarity to prostatic and lysosomal acid phosphatases. Alternatively spliced transcript variants have been described, but their biological validity has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Acp4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- ACTTAGAAGCCCATAGGGGTGCAG -3' (R):5'- TGAGTCTGAGGCTAATGAGCAGGTG -3' Sequencing Primer (F):5'- GCTCAGGAAAGCCTTGTAAC -3' (R):5'- CTAATGAGCAGGTGAGGCCAC -3' |
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Posted On | 2014-02-18 |