ID | 175060 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lilrb4a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000112148 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B, member 4A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gp49b, CD85K, ILT3, Lilrb4, HM18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039379-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.114) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1313 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 150 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 51367052-51372707 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 51356832 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Isoleucine at position 6 (T6I) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000099958 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000102894] [ENSMUST00000217706] [ENSMUST00000218123] [ENSMUST00000219696] [ENSMUST00000218704] [ENSMUST00000219960] [ENSMUST00000219661] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000102894 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.254 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000099958 Gene: ENSMUSG00000112023 AA Change: T6I
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105481 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.045 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101121 Gene: ENSMUSG00000062593 AA Change: T6I
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105482 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.045 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101122 Gene: ENSMUSG00000062593 AA Change: T6I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000139982 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000217706 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.045 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000218123 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.207 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.88) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218179 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000219696 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.045 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000218704 AA Change: T6I |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000219960 AA Change: T6I |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000219661 AA Change: T6I PolyPhen 2 Score 0.004 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.59) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219151 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219178 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219262 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219717 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219598 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218900 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000218649 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000219053 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Homozygotes for a targeted null mutation exhibit increased sensitivity to IgE-dependent passive cutaneous anaphylaxis and a reduced threshold for antigen challenge in active cutaneous anaphylaxis. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Lilrb4a |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGTGTTTACGCAGTCATCTGCTCTTAG -3' (R):5'- GGTGTCCTGTGAAGAAATCAAAAGCCC -3' Sequencing Primer (F):5'- CTTAGGAAATTACAGAGGTTTCCC -3' (R):5'- AACCTGGCTGTCGAATAGGT -3' |
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Posted On | 2014-04-24 |