ID | 179058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tmem79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000001420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transmembrane protein 79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Matt, mattrin, 2310042N02Rik, ma, 2310074C17Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 88236351-88241761 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 88237145 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Asparagine to Aspartic acid at position 353 (N353D) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000103177 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000001454] [ENSMUST00000001456] [ENSMUST00000107552] [ENSMUST00000107553] [ENSMUST00000131666] [ENSMUST00000177005] [ENSMUST00000176425] [ENSMUST00000176519] [ENSMUST00000193872] [ENSMUST00000154381] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9D709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000001454 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001454 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000001456 AA Change: N353D PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000001456 Gene: ENSMUSG00000001420 AA Change: N353D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000107552 AA Change: N353D PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103176 Gene: ENSMUSG00000001420 AA Change: N353D
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000107553 AA Change: N353D PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103177 Gene: ENSMUSG00000001420 AA Change: N353D
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131666 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120235 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140039 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152801 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153716 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000193646 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000177005 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135398 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176425 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135575 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176519 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135263 Gene: ENSMUSG00000001418
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000193872 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141830 Gene: ENSMUSG00000001420
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154381 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134809 Gene: ENSMUSG00000001418
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a spontaneous mutation exhibit abnormal coat/hair pigmentation, abnormal zigzag hair morphology, and a more sparse and shiny coat than wild-type controls. Some adults display a mild irritation around the eyes. [provided by MGI curators] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tmem79 |
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Posted On | 2014-05-07 |