ID | 182542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Trnau1ap | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tRNA selenocysteine 1 associated protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 1110007F05Rik, SECp43, Trspap1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.968) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 132039074-132056849 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 132041298 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000127273 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000030730] [ENSMUST00000105962] [ENSMUST00000125513] [ENSMUST00000147652] [ENSMUST00000127402] [ENSMUST00000137520] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q80VC6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000030730 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030730 Gene: ENSMUSG00000028898
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082670 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083015 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083163 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105962 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101582 Gene: ENSMUSG00000028898
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000116965 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000125513 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146166 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150959 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147652 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127273 Gene: ENSMUSG00000028898
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128000 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128131 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131524 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153474 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137343 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144705 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000182826 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000196061 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126380 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127402 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120657 Gene: ENSMUSG00000028898
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000137520 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000232301 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000232260 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000231453 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for an allele lacking exons 7 and 8 exhibit prenatal lethality. Mice homozygous for a conditional allele activated in neurons exhibit impaired performance on a rotarod. [provided by MGI curators] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Trnau1ap |
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Posted On | 2014-05-07 |