ID | 202691 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lhb | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000100916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | luteinizing hormone beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | LH, leutropin, Gm29035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.179) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | Y5377 () | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 45070370-45071278 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 45070723 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Alanine to Threonine at position 34 (A34T) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000072276 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000058879] [ENSMUST00000072453] [ENSMUST00000107771] [ENSMUST00000210271] [ENSMUST00000210439] [ENSMUST00000211214] [ENSMUST00000211666] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000058879 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000057916 Gene: ENSMUSG00000074121
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000072453 AA Change: A34T PolyPhen 2 Score 0.085 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.85) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000072276 Gene: ENSMUSG00000100916 AA Change: A34T
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000107771 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103400 Gene: ENSMUSG00000003868
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209426 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000210271 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000210439 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000211214 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000211478 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000211440 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000211666 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene is a member of the glycoprotein hormone beta chain family and encodes the beta subunit of luteinizing hormone (LH). Glycoprotein hormones are heterodimers consisting of a common alpha subunit and an unique beta subunit which confers biological specificity. LH is expressed in the pituitary gland and promotes spermatogenesis and ovulation by stimulating the testes and ovaries to synthesize steroids. The genes for the beta chains of chorionic gonadotropin and for luteinizing hormone are contiguous on chromosome 19q13.3. Mutations in this gene are associated with hypogonadism which is characterized by infertility and pseudohermaphroditism. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Homozygous null mice display male and female infertility, hypogonadism, azoospermia, absent corpora lutea, degenerating oocytes, and reduced serum levels of estradiol, progesterone, and testosterone. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Lhb |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AACAGATTTCATGGCTGGTGATG -3' (R):5'- AAGCCCTCTTCTGAGTGTCC -3' Sequencing Primer (F):5'- ATGGGTCTTGAAGGACAGTTTC -3' (R):5'- CGCTCTAGGTGGAATGCC -3' |
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Posted On | 2014-06-23 |