ID | 240700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zic4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000036972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger protein of the cerebellum 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040242-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.270) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2242 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 91247636-91271404 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 91260706 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000133808 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000066384] [ENSMUST00000172646] [ENSMUST00000173054] [ENSMUST00000173342] [ENSMUST00000174212] [ENSMUST00000173933] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q61467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000066384 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000069568 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000085242 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000082339 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170572 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000172646 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134053 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000172858 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133795 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173054 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134364 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173342 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174611 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000195215 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174802 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174212 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133808 Gene: ENSMUSG00000036972
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173933 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133958 Gene: ENSMUSG00000036972
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the ZIC family of C2H2-type zinc finger proteins. Members of this family are important during development, and have been associated with X-linked visceral heterotaxy and holoprosencephaly type 5. This gene is closely linked to the gene encoding zinc finger protein of the cerebellum 1, a related family member on chromosome 3. Heterozygous deletion of these linked genes is involved in Dandy-Walker malformation, which is a congenital cerebellar malformation. Multiple transcript variants have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2009] PHENOTYPE: Mice heterozygous for a knock-out allele exhibit posterior cerebellar hypoplasia and a mild defect in anterior cerebellar foliation. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zic4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TAAGGGTCTTACACCTCTGCAG -3' (R):5'- AGGAGTCCGTTCAAAGGACG -3' Sequencing Primer (F):5'- TCTGCAGCAGAGGCCGTG -3' (R):5'- CGTTCAAAGGACGGCTGTG -3' |
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Posted On | 2014-10-15 |