ID | 245118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Dxo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000040482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | decapping exoribonuclease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Dom3z | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040293-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.147) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2294 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 35055998-35058162 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice acceptor site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to A at 35057962 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000137234 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000046022] [ENSMUST00000046244] [ENSMUST00000077477] [ENSMUST00000159333] [ENSMUST00000161885] [ENSMUST00000173063] [ENSMUST00000173768] [ENSMUST00000173768] [ENSMUST00000174092] [ENSMUST00000173415] [ENSMUST00000173995] [ENSMUST00000173874] [ENSMUST00000172612] [ENSMUST00000180043] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000046022 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000036265 Gene: ENSMUSG00000040356
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000046244 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000047018 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000077477 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000076686 Gene: ENSMUSG00000061207
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159333 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125311 Gene: ENSMUSG00000061207
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160993 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161238 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161885 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173063 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000173768 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134052 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000173768 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134052 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000174092 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133587 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174569 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133448 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000172803 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000173644 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174363 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174226 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000172878 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174684 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134653 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173415 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134209 Gene: ENSMUSG00000040356
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173995 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134583 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173874 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134332 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000172612 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133376 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000180043 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137234 Gene: ENSMUSG00000040482
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000183497 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174887 |
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Meta Mutation Damage Score | 0.9579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (30/30) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene localizes to the major histocompatibility complex (MHC) class III region on chromosome 6. The function of its protein product is unknown, but its ubiquitous expression and conservation in both simple and complex eukaryotes suggests that this may be a housekeeping gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Dxo |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGACCGAGAAGGCTGGAATC -3' (R):5'- GGTGACTCCATTCAGACACAGC -3' Sequencing Primer (F):5'- GGAATCCCTCTGTGTGCATGAAC -3' (R):5'- TTATTATCTGCACGGAGCCCAGAC -3' |
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Posted On | 2014-10-30 |