ID | 247161 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | 4930503L19Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000044906 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RIKEN cDNA 4930503L19 gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Las2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.083) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2361 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 70585283-70605580 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 70602646 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glutamine to Lysine at position 56 (Q56K) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000148553 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000067556] [ENSMUST00000114959] [ENSMUST00000164223] [ENSMUST00000168249] [ENSMUST00000173951] [ENSMUST00000174118] [ENSMUST00000174667] [ENSMUST00000212074] [ENSMUST00000212982] [ENSMUST00000212539] [ENSMUST00000212155] [ENSMUST00000212683] [ENSMUST00000211817] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8CB14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000067556 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.942 (Sensitivity: 0.80; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000065118 Gene: ENSMUSG00000044906 AA Change: Q56K
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114959 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110609 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164223 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126055 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168249 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130991 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173951 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134211 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174118 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134511 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000174667 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133956 Gene: ENSMUSG00000079608
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000212074 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.851 (Sensitivity: 0.83; Specificity: 0.93) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000212982 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.411 (Sensitivity: 0.89; Specificity: 0.90) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000212539 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.271 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000212155 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.928 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000212683 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000211817 AA Change: Q56K PolyPhen 2 Score 0.004 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.59) |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in 4930503L19Rik |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGGTCCAACTTTCTAAGGCCC -3' (R):5'- GAATAACTCCTTTTGAGAAAGCCATGG -3' Sequencing Primer (F):5'- GGTCCAACTTTCTAAGGCCCATTTC -3' (R):5'- GCCATGGCGAAGTTAAACAC -3' |
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Posted On | 2014-10-30 |