ID | 255343 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdca3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000023505 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cell division cycle associated 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TOME-1, Grcc8, 2410005A12Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.434) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2975 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 143 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 124806533-124810664 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site (3 bp from exon) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 124807616 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000120626 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000024206] [ENSMUST00000024270] [ENSMUST00000047510] [ENSMUST00000122110] [ENSMUST00000131847] [ENSMUST00000131847] [ENSMUST00000150120] [ENSMUST00000150120] [ENSMUST00000151674] [ENSMUST00000151674] [ENSMUST00000153306] [ENSMUST00000142058] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99M54 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000024206 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000024206 Gene: ENSMUSG00000023439
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000024270 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000047510 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000041299 Gene: ENSMUSG00000038429
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122110 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114000 Gene: ENSMUSG00000038429
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129251 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000131847 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000131847 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134637 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000150120 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000150120 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000151674 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000151674 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136692 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140233 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153306 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118200 Gene: ENSMUSG00000038429
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000142058 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117439 Gene: ENSMUSG00000038429
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Cdca3 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGAGTCTCTTCTGACGGACG -3' (R):5'- CCAGTGCAGGTTAAAGAATGC -3' Sequencing Primer (F):5'- TGACGGACGTCCCTTCC -3' (R):5'- GAGAAAGTAGGGTTCCAGTG -3' |
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Posted On | 2014-12-29 |