ID | 256057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ing4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | inhibitor of growth family, member 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D6Xrf92, p29ING4, D6Wsu147e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.600) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2969 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 125016811-125026228 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 125024288 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Lysine to Glutamic Acid at position 131 (K131E) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000121519 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032480] [ENSMUST00000032481] [ENSMUST00000088294] [ENSMUST00000112413] [ENSMUST00000112414] [ENSMUST00000112417] [ENSMUST00000140131] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8C0D7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032480 AA Change: S131G PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032480 Gene: ENSMUSG00000030330 AA Change: S131G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032481 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032481 Gene: ENSMUSG00000072770
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000088294 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000085632 Gene: ENSMUSG00000072770
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000112412 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000108031 Gene: ENSMUSG00000072770
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000112413 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000108032 Gene: ENSMUSG00000072770
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000112414 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000108033 Gene: ENSMUSG00000072770
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000112417 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000108036 Gene: ENSMUSG00000030330
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000140131 AA Change: K131E PolyPhen 2 Score 0.010 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.77) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121519 Gene: ENSMUSG00000030330 AA Change: K131E
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151125 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119709 Gene: ENSMUSG00000030330
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133695 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152574 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000203287 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140883 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118561 Gene: ENSMUSG00000030330
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156091 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128277 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146229 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000205110 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a tumor suppressor protein that contains a PHD-finger, which is a common motif in proteins involved in chromatin remodeling. This protein can bind TP53 and EP300/p300, a component of the histone acetyl transferase complex, suggesting its involvement in the TP53-dependent regulatory pathway. Multiple alternatively spliced transcript variants have been observed that encode distinct proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a gene trapped allele are hypersensitive to LPS challenge and exhibit elevated cytokine responses. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ing4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGTTTTCCTTGATCGGAGCC -3' (R):5'- ACTTCTTCTGGGCAGCCTTG -3' Sequencing Primer (F):5'- CTTGATCGGAGCCAGGCTTG -3' (R):5'- TCCCTTTGGAACGGGCTCTG -3' |
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Posted On | 2014-12-29 |