ID | 257424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Csnk1e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | casein kinase 1, epsilon | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | tau, CKIepsilon, CK1epsilon, CKI epsilon, KC1epsilon | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3005 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 79302056-79339767 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 79323005 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Isoleucine to Valine at position 15 (I15V) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000155731 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000117786] [ENSMUST00000120859] [ENSMUST00000122044] [ENSMUST00000135519] [ENSMUST00000144790] [ENSMUST00000156043] [ENSMUST00000230599] [ENSMUST00000230942] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JMK2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000117786 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.248 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113341 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120859 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.248 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113975 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000122044 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.106 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.86) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113096 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000135519 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.318 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122135 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144790 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.034 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.82) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115637 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000156043 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.248 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116593 Gene: ENSMUSG00000022433 AA Change: I15V
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230599 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.049 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230942 AA Change: I15V PolyPhen 2 Score 0.421 (Sensitivity: 0.89; Specificity: 0.90) |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: The protein encoded by this gene is a serine/threonine protein kinase and a member of the casein kinase I protein family, whose members have been implicated in the control of cytoplasmic and nuclear processes, including DNA replication and repair. The encoded protein is found in the cytoplasm as a monomer and can phosphorylate a variety of proteins, including itself. This protein has been shown to phosphorylate period, a circadian rhythm protein. Three transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014] PHENOTYPE: Mice homozygous for a null allele exhibit disruptions in circadian rhythms. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Csnk1e |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGCTGTGAAAGAAGACATTCCCC -3' (R):5'- AGCTAAGTGAAGCCAGATTGC -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGCTTCCTTCTGGATCCGG -3' (R):5'- AGCCAGATTGCTTCTCAGACAGTG -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |