ID | 257688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rad51ap1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | RAD51 associated protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2510006L10Rik, RAB22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3018 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 126900378-126916664 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | start gained | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 126916485 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000122978 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032497] [ENSMUST00000112220] [ENSMUST00000112221] [ENSMUST00000144954] [ENSMUST00000202897] [ENSMUST00000201617] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032497 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032497 Gene: ENSMUSG00000030347
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000112220 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000107839 Gene: ENSMUSG00000030346
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000112221 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000107841 Gene: ENSMUSG00000030346
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000141212 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000144954 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122978 Gene: ENSMUSG00000030346
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201113 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201603 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202835 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202897 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202086 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201617 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144570 Gene: ENSMUSG00000030347
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rad51ap1 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTCAAATGCTAGCCTACCAGGTC -3' (R):5'- TCTGAGCAGACAGGATCCAG -3' Sequencing Primer (F):5'- AGCCTACCAGGTCCCTCTG -3' (R):5'- CAGGATCCAGGATGGCGTG -3' |
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Posted On | 2015-01-11 |