ID | 261102 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slc25a40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054099 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 25, member 40 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | B230315F11Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040495-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2908 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 8472850-8504797 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 8477505 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Isoleucine at position 30 (T30I) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000143045 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000002368] [ENSMUST00000066921] [ENSMUST00000168500] [ENSMUST00000170496] [ENSMUST00000171808] [ENSMUST00000198792] [ENSMUST00000196727] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8BGP6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000002368 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000002368 Gene: ENSMUSG00000002297
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000066921 AA Change: T30I PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000067611 Gene: ENSMUSG00000054099 AA Change: T30I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000166364 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000168500 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132985 Gene: ENSMUSG00000002297
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000170496 AA Change: T30I PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130630 Gene: ENSMUSG00000054099 AA Change: T30I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000170927 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000171808 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132906 Gene: ENSMUSG00000002297
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000198792 AA Change: T30I PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143045 Gene: ENSMUSG00000054099 AA Change: T30I
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000196727 AA Change: T30I PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142511 Gene: ENSMUSG00000054099 AA Change: T30I
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000197006 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000199817 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000199532 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198785 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] SLC25A40 belongs to the SLC25 family of mitochondrial carrier proteins (Haitina et al., 2006 [PubMed 16949250]).[supplied by OMIM, Mar 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a gene-trapped allele are viable and overtly normal in a battery of physiological, metabolic, and behavioral assays. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Slc25a40 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TTGCACACTGGCTTCCATTTATAAC -3' (R):5'- GTTTTCCTCATGCACACGTG -3' Sequencing Primer (F):5'- ATGTTAGGCAAGCACTCCTG -3' (R):5'- GTGCACAAATAACAAACATGCATATG -3' |
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Posted On | 2015-01-23 |