ID | 261561 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gpt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000022546 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glutamic pyruvic transaminase, soluble | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Gpt-1, 1300007J06Rik, Gpt1, ALT, 2310022B03Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040490-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2903 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 76580926-76583875 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 76582666 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Aspartic acid to Glycine at position 37 (D37G) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000155686 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000019224] [ENSMUST00000023203] [ENSMUST00000037551] [ENSMUST00000135388] [ENSMUST00000229734] [ENSMUST00000229140] [ENSMUST00000229679] [ENSMUST00000231028] [ENSMUST00000150399] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8QZR5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000019224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000019224 Gene: ENSMUSG00000019080
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000023203 AA Change: D277G PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000023203 Gene: ENSMUSG00000022546 AA Change: D277G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000037551 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000037356 Gene: ENSMUSG00000033819
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127674 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134449 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000135388 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140730 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000229734 AA Change: D256G PolyPhen 2 Score 0.929 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000229140 AA Change: D37G PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000229679 AA Change: D277G PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231028 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229018 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230468 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229340 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229098 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229856 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230482 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000150399 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123458 Gene: ENSMUSG00000033819
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000228987 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230283 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000156920 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes cytosolic alanine aminotransaminase 1 (ALT1); also known as glutamate-pyruvate transaminase 1. This enzyme catalyzes the reversible transamination between alanine and 2-oxoglutarate to generate pyruvate and glutamate and, therefore, plays a key role in the intermediary metabolism of glucose and amino acids. Serum activity levels of this enzyme are routinely used as a biomarker of liver injury caused by drug toxicity, infection, alcohol, and steatosis. A related gene on chromosome 16 encodes a putative mitochondrial alanine aminotransaminase.[provided by RefSeq, Nov 2009] PHENOTYPE: Electrophoretic variants are detected in C57BL/6, BALB/c and DBA/2 (a allele); in MA/J and NZB/Bl (b allele). M. m. molossinus and M. m. castaneus have either the b or c allele. In liver, GPT1 activity rises dramatically at 12-19 days to adult levels. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Gpt |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGCATCTTCACACTCCAGGG -3' (R):5'- AGCATGAGTTGAGGCTGGTC -3' Sequencing Primer (F):5'- TTCACACTCCAGGGCAGGTG -3' (R):5'- AGTGACTGAGAGTCCTCTAGC -3' |
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Posted On | 2015-01-23 |