ID | 263300 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ercc8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000021694 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | excision repaiross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | B130065P18Rik, 2810431L23Rik, 4631412O06Rik, 2410022P04Rik, Ckn1, Csa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040523-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.282) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R2967 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 108295265-108331898 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 108297248 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Proline to Threonine at position 53 (P53T) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000122802 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000054835] [ENSMUST00000120672] [ENSMUST00000123182] [ENSMUST00000123657] [ENSMUST00000129117] [ENSMUST00000133957] [ENSMUST00000142931] [ENSMUST00000152634] [ENSMUST00000163558] [ENSMUST00000223734] [ENSMUST00000225702] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8CFD5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000054835 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 0.003 (Sensitivity: 0.98; Specificity: 0.44) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000059211 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120672 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 0.011 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.78) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112746 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000123138 AA Change: P49T |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119212 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P49T
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000123182 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121777 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000123657 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117492 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000129117 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116507 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000133957 AA Change: P50T PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116226 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P50T
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137425 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000142931 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 0.013 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.78) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118154 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000152634 AA Change: P53T PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122802 Gene: ENSMUSG00000021694 AA Change: P53T
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000163558 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130532 Gene: ENSMUSG00000068184
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000223734 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000225830 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000225702 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a WD repeat protein, which interacts with Cockayne syndrome type B (CSB) protein and with p44 protein, a subunit of the RNA polymerase II transcription factor IIH. Mutations in this gene have been identified in patients with hereditary disease Cockayne syndrome (CS). CS cells are abnormally sensitive to ultraviolet radiation and are defective in the repair of transcriptionally active genes. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2014] PHENOTYPE: Homozygous mutation of this gene results in skin photosensitivity, increased incidence of skin tumors after UV exposure, and progressive photoreceptor degeneration. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ercc8 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGCCTTGCAGAATTTGTGGTAATC -3' (R):5'- GGCATCAACATAAATCCCTGGC -3' Sequencing Primer (F):5'- ATTTGTGGTAATCTTGGGGAAATAAG -3' (R):5'- CCCTGGCTTATTGATTTAACATGAAC -3' |
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Posted On | 2015-02-05 |