ID | 264055 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tomm40l | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005674 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | translocase of outer mitochondrial membrane 40-like | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.260) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3083 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 171043579-171050020 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 171048780 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Leucine to Histidine at position 78 (L78H) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000119006 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000005817] [ENSMUST00000005820] [ENSMUST00000005824] [ENSMUST00000075469] [ENSMUST00000111319] [ENSMUST00000111320] [ENSMUST00000111321] [ENSMUST00000111327] [ENSMUST00000147246] [ENSMUST00000111326] [ENSMUST00000138184] [ENSMUST00000133075] [ENSMUST00000111328] [ENSMUST00000143405] [ENSMUST00000155126] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9CZR3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000005817 AA Change: L78H PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000005817 Gene: ENSMUSG00000005674 AA Change: L78H
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000005820 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000005820 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000005824 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000005824 Gene: ENSMUSG00000005681
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000075469 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000074915 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111319 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106951 Gene: ENSMUSG00000005681
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111320 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106952 Gene: ENSMUSG00000005681
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111321 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106953 Gene: ENSMUSG00000005681
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000111327 AA Change: L78H PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106959 Gene: ENSMUSG00000005674 AA Change: L78H
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000147246 AA Change: L78H PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119006 Gene: ENSMUSG00000005674 AA Change: L78H
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000111326 AA Change: L78H PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106958 Gene: ENSMUSG00000005674 AA Change: L78H
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000138184 AA Change: L78H PolyPhen 2 Score 0.999 (Sensitivity: 0.14; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115877 Gene: ENSMUSG00000005674 AA Change: L78H
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137298 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152865 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130529 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154106 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149404 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133075 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137852 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111328 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106960 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000143405 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155126 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137683 Gene: ENSMUSG00000005677
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tomm40l |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTTTGCACAGGACTAGCTCG -3' (R):5'- TGCCTTTAAGCAACAAGATGTGG -3' Sequencing Primer (F):5'- ACTAGCTCGCGTTCAGAAG -3' (R):5'- TGCTTAAAGTCCAGTGGCC -3' |
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Posted On | 2015-02-05 |