ID | 265842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Zfp513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000043059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger protein 513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D430028M17Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040543-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.933) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3027 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 31356325-31359647 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 31356673 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Serine to Proline at position 540 (S540P) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000110238 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000031029] [ENSMUST00000031032] [ENSMUST00000031562] [ENSMUST00000114590] [ENSMUST00000200730] [ENSMUST00000201968] [ENSMUST00000201231] [ENSMUST00000201535] [ENSMUST00000202294] [ENSMUST00000201679] [ENSMUST00000202124] [ENSMUST00000202929] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q6PD29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031029 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031029 Gene: ENSMUSG00000029146
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031032 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031032 Gene: ENSMUSG00000029147
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031562 AA Change: S538P PolyPhen 2 Score 0.002 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.30) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031562 Gene: ENSMUSG00000043059 AA Change: S538P
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000114590 AA Change: S540P PolyPhen 2 Score 0.734 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110238 Gene: ENSMUSG00000043059 AA Change: S540P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200730 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144504 Gene: ENSMUSG00000029146
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000200992 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201078 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202402 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202743 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201835 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201119 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202032 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202318 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201343 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000202323 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201968 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144517 Gene: ENSMUSG00000043059
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201231 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144172 Gene: ENSMUSG00000043059
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201535 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144643 Gene: ENSMUSG00000029146
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202294 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144644 Gene: ENSMUSG00000029147
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201679 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144688 Gene: ENSMUSG00000029146
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202124 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144168 Gene: ENSMUSG00000029146
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202929 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143817 Gene: ENSMUSG00000043059
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Meta Mutation Damage Score | 0.0604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (33/33) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene is a possible transcriptional regulator involved in retinal development. Defects in this gene can be a cause of autosomal-recessive retinitis pigmentosa. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Zfp513 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- ATCACTTAGCTCATCTGGTACGTG -3' (R):5'- CACTGGGACAACTACAAGCG -3' Sequencing Primer (F):5'- CTCATCTGGTACGTGAGCTAAGAC -3' (R):5'- CTACAAGCGTCATCAGAAGGTGC -3' |
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Posted On | 2015-02-05 |