ID | 274115 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sco2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000091780 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SCO2 cytochrome c oxidase assembly protein | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 040768-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3812 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 89255840-89258049 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | utr 5 prime | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 89257882 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000155150 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000023285] [ENSMUST00000036987] [ENSMUST00000049968] [ENSMUST00000074552] [ENSMUST00000088717] [ENSMUST00000167643] [ENSMUST00000227834] [ENSMUST00000145259] [ENSMUST00000228977] [ENSMUST00000228111] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8VCL2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000023285 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000023285 Gene: ENSMUSG00000022615
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000036987 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000036900 Gene: ENSMUSG00000008690
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000049968 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000053112 Gene: ENSMUSG00000047394
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000074552 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000074139 Gene: ENSMUSG00000008690
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000088717 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000086095 Gene: ENSMUSG00000008690
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134900 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136638 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000167643 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131943 Gene: ENSMUSG00000091780
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140665 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147207 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000147733 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151523 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000227834 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000227203 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000145259 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000228005 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000228977 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000226267 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000228111 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000227854 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (28/28) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Cytochrome c oxidase (COX) catalyzes the transfer of electrons from cytochrome c to molecular oxygen, which helps to maintain the proton gradient across the inner mitochondrial membrane that is necessary for aerobic ATP production. Human COX is a multimeric protein complex that requires several assembly factors; this gene encodes one of the COX assembly factors. The encoded protein is a metallochaperone that is involved in the biogenesis of cytochrome c oxidase subunit II. Mutations in this gene are associated with fatal infantile encephalocardiomyopathy and myopia 6. [provided by RefSeq, Oct 2014] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit embryonic lethality. Mice heterozygous for a knock-out allele and a knock-in allele exhibit muscle weakness and reduced exercise endurance. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Sco2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTCGATCTGATAGCACGAGC -3' (R):5'- CGGATATCAACGGCACCAGATC -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGCGCCCCCTGGAGAG -3' (R):5'- TTCCTGGTCCTGGCACGTG -3' |
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Posted On | 2015-04-02 |