ID | 291898 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nr1i3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000005677 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nuclear receptor subfamily 1, group I, member 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | mCAR, ESTM32, CAR, CAR1, MB67, Care2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL02401 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 171041503-171046414 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 171043942 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000137683 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000005817] [ENSMUST00000005820] [ENSMUST00000075469] [ENSMUST00000111326] [ENSMUST00000111327] [ENSMUST00000111328] [ENSMUST00000155126] [ENSMUST00000133075] [ENSMUST00000143405] [ENSMUST00000147246] [ENSMUST00000138184] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | O35627 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000005817 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000005817 Gene: ENSMUSG00000005674
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000005820 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000005820 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000075469 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000074915 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111326 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106958 Gene: ENSMUSG00000005674
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111327 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106959 Gene: ENSMUSG00000005674
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111328 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106960 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000130529 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137298 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155126 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137683 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133075 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137852 Gene: ENSMUSG00000005677
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152865 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149404 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154106 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000143405 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147246 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119006 Gene: ENSMUSG00000005674
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000138184 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115877 Gene: ENSMUSG00000005674
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the nuclear receptor superfamily, and is a key regulator of xenobiotic and endobiotic metabolism. The protein binds to DNA as a monomer or a heterodimer with the retinoid X receptor and regulates the transcription of target genes involved in drug metabolism and bilirubin clearance, such as cytochrome P450 family members. Unlike most nuclear receptors, this transcriptional regulator is constitutively active in the absence of ligand but is regulated by both agonists and inverse agonists. Ligand binding results in translocation of this protein to the nucleus, where it activates or represses target gene transcription. These ligands include bilirubin, a variety of foreign compounds, steroid hormones, and prescription drugs. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit decreased sensitivity to TCPOBOP. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Nr1i3 |
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Posted On | 2015-04-16 |