ID | 312051 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tprkb | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000054226 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Tp53rk binding protein | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610033G21Rik, 1810034M08Rik, DRWMS1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.208) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R3960 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 85888847-85907266 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 85905783 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Glutamic Acid to Glycine at position 156 (E156G) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000144160 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000067137] [ENSMUST00000089570] [ENSMUST00000113751] [ENSMUST00000113752] [ENSMUST00000113753] [ENSMUST00000149026] [ENSMUST00000200680] [ENSMUST00000202803] [ENSMUST00000201939] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8QZZ7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000067137 AA Change: E156G PolyPhen 2 Score 0.017 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000063927 Gene: ENSMUSG00000054226 AA Change: E156G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000089570 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000086998 Gene: ENSMUSG00000054226
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000113751 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109380 Gene: ENSMUSG00000054226
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000113752 AA Change: E156G PolyPhen 2 Score 0.017 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109381 Gene: ENSMUSG00000054226 AA Change: E156G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000113753 AA Change: E156G PolyPhen 2 Score 0.017 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109382 Gene: ENSMUSG00000054226 AA Change: E156G
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149026 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117259 Gene: ENSMUSG00000054226
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150249 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200680 AA Change: E156G PolyPhen 2 Score 0.017 (Sensitivity: 0.95; Specificity: 0.80) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144160 Gene: ENSMUSG00000054226 AA Change: E156G
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000201217 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162660 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124315 Gene: ENSMUSG00000089634
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000202803 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144660 Gene: ENSMUSG00000054226
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000201939 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144588 Gene: ENSMUSG00000054226
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tprkb |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- ATGACAAATTGCCAACAACTTTGA -3' (R):5'- CAATCCAATACAAGATAAAGTGAGGG -3' Sequencing Primer (F):5'- ATAGTAGCACGTGGACAC -3' (R):5'- CCGGCTTTCTGTTGACAT -3' |
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Posted On | 2015-04-29 |