ID | 332608 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tspan1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000028699 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tetraspanin 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 9030418M05Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.076) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00560 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 116019066-116024798 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | unclassified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | G to T at 116020176 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000121906 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000030465] [ENSMUST00000106494] [ENSMUST00000106496] [ENSMUST00000106498] [ENSMUST00000120083] [ENSMUST00000121052] [ENSMUST00000143426] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99J59 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000030465 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030465 Gene: ENSMUSG00000028699
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106494 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102103 Gene: ENSMUSG00000028700
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106496 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102105 Gene: ENSMUSG00000028700
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106498 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000102107 Gene: ENSMUSG00000028700
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120083 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112751 Gene: ENSMUSG00000028700
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000121052 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112911 Gene: ENSMUSG00000028700
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133838 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151325 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136855 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000155718 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154534 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000143426 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121906 Gene: ENSMUSG00000028699
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. [provided by RefSeq, Jul 2008] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tspan1 |
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Posted On | 2015-08-05 |