ID | 500640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tmem150a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000055912 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transmembrane protein 150A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Tmem150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 041731-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.535) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R4474 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 72332466-72336745 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 72334035 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Serine to Phenylalanine at position 39 (S39F) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000138445 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000069580] [ENSMUST00000069595] [ENSMUST00000069695] [ENSMUST00000077783] [ENSMUST00000114095] [ENSMUST00000132243] [ENSMUST00000206064] [ENSMUST00000154098] [ENSMUST00000130064] [ENSMUST00000151063] [ENSMUST00000149296] [ENSMUST00000206531] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q91WN2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000069580 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000066128 Gene: ENSMUSG00000055850
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000069595 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000070370 Gene: ENSMUSG00000055850
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000069695 AA Change: S39F PolyPhen 2 Score 0.047 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000063977 Gene: ENSMUSG00000055912 AA Change: S39F
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000077783 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000076957 Gene: ENSMUSG00000058706
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114095 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109729 Gene: ENSMUSG00000055850
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000125554 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000132243 AA Change: S39F PolyPhen 2 Score 0.272 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138445 Gene: ENSMUSG00000055912 AA Change: S39F
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206064 AA Change: S39F PolyPhen 2 Score 0.015 (Sensitivity: 0.96; Specificity: 0.79) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000206319 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000205399 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154098 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138327 Gene: ENSMUSG00000055850
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130064 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115187 Gene: ENSMUSG00000055850
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000151063 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133978 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000126065 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136707 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149296 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129233 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206531 AA Change: S23F PolyPhen 2 Score 0.047 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.83) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000206821 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 95% (36/38) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tmem150a |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GCATGACATCCTGTTCATCTGC -3' (R):5'- GGATGCCCAGCTCCTAGAAATAG -3' Sequencing Primer (F):5'- ACATCCTGTTCATCTGCCCACTTC -3' (R):5'- ACTGCTTTCCAAGAGCTAGG -3' |
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Posted On | 2017-12-01 |