ID | 501226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pcbp2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000056851 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | poly(rC) binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | alphaCP-2, Hnrpx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 043299-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably essential (E-score: 0.970) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R5653 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 102378974-102408496 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 102395524 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Alanine to Valine at position 141 (A141V) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000155431 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000077037] [ENSMUST00000078404] [ENSMUST00000108838] [ENSMUST00000229061] [ENSMUST00000229102] [ENSMUST00000229958] [ENSMUST00000229918] [ENSMUST00000229746] [ENSMUST00000229854] [ENSMUST00000229802] [ENSMUST00000230114] [ENSMUST00000229618] [ENSMUST00000229184] [ENSMUST00000229222] [ENSMUST00000231089] [ENSMUST00000230211] [ENSMUST00000230577] [ENSMUST00000230918] [ENSMUST00000231085] [ENSMUST00000230728] [ENSMUST00000230539] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q61990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000077037 AA Change: A225V PolyPhen 2 Score 0.981 (Sensitivity: 0.75; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000076294 Gene: ENSMUSG00000056851 AA Change: A225V
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000078404 AA Change: A225V PolyPhen 2 Score 0.981 (Sensitivity: 0.75; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000077509 Gene: ENSMUSG00000056851 AA Change: A225V
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000108838 AA Change: A198V PolyPhen 2 Score 0.955 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104466 Gene: ENSMUSG00000056851 AA Change: A198V
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000181328 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184881 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000229061 AA Change: A61V PolyPhen 2 Score 0.996 (Sensitivity: 0.55; Specificity: 0.98) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229102 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000229958 AA Change: A229V PolyPhen 2 Score 0.671 (Sensitivity: 0.86; Specificity: 0.91) |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000229533 AA Change: A142V |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229918 AA Change: A198V PolyPhen 2 Score 0.322 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229746 AA Change: A156V PolyPhen 2 Score 0.210 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.88) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000229854 AA Change: A225V PolyPhen 2 Score 0.981 (Sensitivity: 0.75; Specificity: 0.96) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229802 AA Change: A198V PolyPhen 2 Score 0.322 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000230114 AA Change: A225V PolyPhen 2 Score 0.989 (Sensitivity: 0.72; Specificity: 0.97) |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000229432 AA Change: A56V |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000229618 AA Change: A194V PolyPhen 2 Score 0.963 (Sensitivity: 0.78; Specificity: 0.95) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230129 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229219 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000229822 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229184 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000229222 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231089 AA Change: A194V PolyPhen 2 Score 0.178 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230211 AA Change: A160V PolyPhen 2 Score 0.188 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000230577 AA Change: A198V PolyPhen 2 Score 0.990 (Sensitivity: 0.72; Specificity: 0.97) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230918 AA Change: A163V PolyPhen 2 Score 0.365 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000231085 AA Change: A141V PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000230728 AA Change: A229V PolyPhen 2 Score 0.954 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230631 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230282 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230539 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000230997 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000230682 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene appears to be multifunctional. Along with PCBP-1 and hnRNPK, it is one of the major cellular poly(rC)-binding proteins. The encoded protein contains three K-homologous (KH) domains which may be involved in RNA binding. Together with PCBP-1, this protein also functions as a translational coactivator of poliovirus RNA via a sequence-specific interaction with stem-loop IV of the IRES, promoting poliovirus RNA replication by binding to its 5'-terminal cloverleaf structure. It has also been implicated in translational control of the 15-lipoxygenase mRNA, human papillomavirus type 16 L2 mRNA, and hepatitis A virus RNA. The encoded protein is also suggested to play a part in formation of a sequence-specific alpha-globin mRNP complex which is associated with alpha-globin mRNA stability. This multiexon structural mRNA is thought to be retrotransposed to generate PCBP-1, an intronless gene with functions similar to that of PCBP2. This gene and PCBP-1 have paralogous genes (PCBP3 and PCBP4) which are thought to have arisen as a result of duplication events of entire genes. Thsi gene also has two processed pseudogenes (PCBP2P1 and PCBP2P2). Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice heterozygous for a knock-out allele exhibit decreased body weight, impaired erythroblast maturation and lowered mean platelet counts. Mice homozygous for this allele die between E12.5 and E15.5 with hemorrhage and edema. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pcbp2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TTTGGGGCTCAAAGAAGGC -3' (R):5'- AGGGGTTTCACATTCAAAGGC -3' Sequencing Primer (F):5'- AGAAGGCCAGCTCAGTTCTGAC -3' (R):5'- GGGGTTTCACATTCAAAGGCTAACAC -3' |
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Posted On | 2017-12-01 |