ID | 516197 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ackr4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000079355 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | atypical chemokine receptor 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | A630091E18Rik, CCX-CKR, PPR1, CCBP2, CCR11, VSHK1, Ccrl1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 044419-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R6402 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225.009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 103974881-104003842 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 103976144 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Isoleucine to Phenylalanine at position 268 (I268F) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000152036 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000047799] [ENSMUST00000076147] [ENSMUST00000120854] [ENSMUST00000188000] [ENSMUST00000189998] [ENSMUST00000219146] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q924I3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000047799 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000043424 Gene: ENSMUSG00000090150
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000050139 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000062941 Gene: ENSMUSG00000041748
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000076147 AA Change: I268F PolyPhen 2 Score 0.955 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000075507 Gene: ENSMUSG00000079355 AA Change: I268F
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120854 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000112994 Gene: ENSMUSG00000090150
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000154431 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000188000 AA Change: I268F PolyPhen 2 Score 0.955 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140792 Gene: ENSMUSG00000079355 AA Change: I268F
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000189998 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000219146 AA Change: I268F PolyPhen 2 Score 0.955 (Sensitivity: 0.79; Specificity: 0.95) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000214661 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this gene is a member of the G protein-coupled receptor family, and is a receptor for C-C type chemokines. This receptor has been shown to bind dendritic cell- and T cell-activated chemokines including CCL19/ELC, CCL21/SLC, and CCL25/TECK. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2013] PHENOTYPE: Mice homozygous for a targeted null mutation do not exhibit any significant abnormalities compared to controls. Mice homozygous for a different knock-out allele exhibit increased susceptibility to experimental autoimmune encephalomyelitis with increased Th17 response. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Ackr4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GCTCTGTAGGACCCTCAGAATC -3' (R):5'- GGTCCCGTTTCTCATCATGG -3' Sequencing Primer (F):5'- TCTGTAGGACCCTCAGAATCAAAAGG -3' (R):5'- CTCATCATGGGCGTGTGC -3' |
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Posted On | 2018-05-04 |