ID | 519215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Stau2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | staufen double-stranded RNA binding protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 044389-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R6447 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225.009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 16298898-16590336 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 16460049 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Glutamic Acid at position 264 (V264E) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000123781 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000027052] [ENSMUST00000054668] [ENSMUST00000127420] [ENSMUST00000128957] [ENSMUST00000131257] [ENSMUST00000149320] [ENSMUST00000151888] [ENSMUST00000162751] [ENSMUST00000159558] [ENSMUST00000162007] [ENSMUST00000162435] [ENSMUST00000162627] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8CJ67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000027052 AA Change: V264E PolyPhen 2 Score 0.915 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000027052 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V264E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000054668 AA Change: V296E PolyPhen 2 Score 0.890 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000053190 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V296E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127420 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122116 Gene: ENSMUSG00000025920
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128957 AA Change: V296E PolyPhen 2 Score 0.366 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122410 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V296E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131257 AA Change: V258E PolyPhen 2 Score 0.403 (Sensitivity: 0.89; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121410 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V258E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000149320 AA Change: V296E PolyPhen 2 Score 0.366 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118489 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V296E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000151888 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125473 Gene: ENSMUSG00000025920
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000162751 AA Change: V296E PolyPhen 2 Score 0.890 (Sensitivity: 0.82; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124505 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V296E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000159558 AA Change: V264E PolyPhen 2 Score 0.538 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125726 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V264E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000162007 AA Change: V264E PolyPhen 2 Score 0.538 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124303 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V264E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000162435 AA Change: V264E PolyPhen 2 Score 0.915 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123827 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V264E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000162627 AA Change: V264E PolyPhen 2 Score 0.915 (Sensitivity: 0.81; Specificity: 0.94) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123781 Gene: ENSMUSG00000025920 AA Change: V264E
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Staufen homolog 2 is a member of the family of double-stranded RNA (dsRNA)-binding proteins involved in the transport and/or localization of mRNAs to different subcellular compartments and/or organelles. These proteins are characterized by the presence of multiple dsRNA-binding domains which are required to bind RNAs having double-stranded secondary structures. Staufen homolog 2 shares 48.5% and 59.9% similarity with drosophila and human staufen, respectively. The exact function of Staufen homolog 2 is not known, but since it contains 3 copies of conserved dsRNA binding domain, it could be involved in double-stranded RNA binding events. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2009] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Stau2 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GCATGTTACTCACTAGAAACCCAAG -3' (R):5'- TGGACCACCACATATGAAGAG -3' Sequencing Primer (F):5'- GACAAATCTAACTCAGTGGTATTTGC -3' (R):5'- GGACCACCACATATGAAGAGTTTTG -3' |
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Posted On | 2018-05-24 |