ID | 52 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gm7634 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000100652 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | predicted gene 7634 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Not available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | N/A - 293 of strain aoba | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 16123559-16124111 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | exon | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 16124084 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Homozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | no structure available at present | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000185778 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 85% (165/193) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Nature of Mutation |
DNA sequencing using the SOLiD technique identified a T to A transversion at position 454 of the Gm7634 transcript. The mutated nucleotide causes a leucine to glutamine substitution at amino acid 144. The mutation has been confirmed by DNA sequencing using the Sanger method. Figure 1 shows a BLAST search using DNA sequence containing the mutated nucleotide.
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Protein Function and Prediction |
Gm7634 is an uncharacterized gene that is predicted to encode a 158 amino acid protein. Analysis using the SMART program predicted the protein to be similar to ribosomal protein L22, one of the proteins from the large ribosomal subunit. The gene has been removed from the NCBI database.
The L144Q change is predicted to be benign by the PolyPhen program.
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Posted On | 2009-11-10 |