ID | 526602 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Alg3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000033809 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D16Ertd36e | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 044776-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly non essential (E-score: 0.260) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R6655 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225.009 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 20424208-20429515 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 20427776 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Phenylalanine at position 12 (Y12F) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000156234 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000045918] [ENSMUST00000079600] [ENSMUST00000096197] [ENSMUST00000115522] [ENSMUST00000119224] [ENSMUST00000123774] [ENSMUST00000231387] [ENSMUST00000231471] [ENSMUST00000231386] [ENSMUST00000231362] [ENSMUST00000231749] [ENSMUST00000231531] [ENSMUST00000147867] [ENSMUST00000231904] [ENSMUST00000232319] [ENSMUST00000159780] [ENSMUST00000120394] [ENSMUST00000232458] [ENSMUST00000232451] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8K2A8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000045918 AA Change: Y86F PolyPhen 2 Score 0.168 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000045272 Gene: ENSMUSG00000033809 AA Change: Y86F
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000046188 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000079600 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000078550 Gene: ENSMUSG00000115293
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000096197 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000093911 Gene: ENSMUSG00000046613
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000115522 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000111184 Gene: ENSMUSG00000115219
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000117019 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000119224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113772 Gene: ENSMUSG00000115219
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123774 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123378 Gene: ENSMUSG00000033809
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000127454 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120559 Gene: ENSMUSG00000033809
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231387 AA Change: Y12F PolyPhen 2 Score 0.090 (Sensitivity: 0.93; Specificity: 0.85) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231471 AA Change: Y86F PolyPhen 2 Score 0.190 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231386 AA Change: Y86F PolyPhen 2 Score 0.059 (Sensitivity: 0.94; Specificity: 0.84) |
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000231362 AA Change: M74L |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231749 AA Change: Y12F PolyPhen 2 Score 0.223 (Sensitivity: 0.91; Specificity: 0.88) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231531 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147867 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231904 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000232319 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159780 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123727 Gene: ENSMUSG00000046613
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000120394 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000113475 Gene: ENSMUSG00000115293
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000231608 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000232458 AA Change: Y12F PolyPhen 2 Score 0.168 (Sensitivity: 0.92; Specificity: 0.87) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000232451 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the ALG3 family. The encoded protein catalyses the addition of the first dol-P-Man derived mannose in an alpha 1,3 linkage to Man5GlcNAc2-PP-Dol. Defects in this gene have been associated with congenital disorder of glycosylation type Id (CDG-Id) characterized by abnormal N-glycosylation. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2008] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Alg3 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- AGCATAGAATAGCCCCGTAAAG -3' (R):5'- TTCACCCAGAGAATGCCGTAG -3' Sequencing Primer (F):5'- TAGAATAGCCCCGTAAAGATGTAC -3' (R):5'- TGTGGTTACATCAGGGACGATAATG -3' |
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Posted On | 2018-07-23 |