ID | 5404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tpra1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000002871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | transmembrane protein, adipocyte asscociated 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Tpra40, 40kDa, Gpr175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.105) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 88879238-88889216 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 88887390 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000145050 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000055022] [ENSMUST00000128790] [ENSMUST00000129979] [ENSMUST00000203185] [ENSMUST00000152585] [ENSMUST00000203648] [ENSMUST00000150236] [ENSMUST00000203694] [ENSMUST00000203345] [ENSMUST00000153874] [ENSMUST00000204765] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99MU1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000055022 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000063042 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123257 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128171 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114865 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128790 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145116 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129979 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145368 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135778 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000138415 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000203185 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145168 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152585 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000203648 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145404 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000151379 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000150236 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145098 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144405 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153885 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152045 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000141163 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000203694 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000203345 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000144846 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148874 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000203155 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153874 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118017 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000204765 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000145050 Gene: ENSMUSG00000002871
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000204584 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tpra1 |
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Posted On | 2012-04-20 |