ID | 62251 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sigirr | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000025494 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sigirr, Tir8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 038836-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.086) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0651 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 81 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 140671088-140680485 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 140672980 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Valine to Aspartic acid at position 69 (V69D) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000066873] [ENSMUST00000097958] [ENSMUST00000106039] [ENSMUST00000210167] [ENSMUST00000209294] [ENSMUST00000209199] [ENSMUST00000209352] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9JLZ8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000066873 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000069961 Gene: ENSMUSG00000054065
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000097958 AA Change: V130D PolyPhen 2 Score 0.352 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000095571 Gene: ENSMUSG00000025494 AA Change: V130D
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106039 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101654 Gene: ENSMUSG00000054065
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159253 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160403 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000160615 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161142 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000209887 AA Change: V69D PolyPhen 2 Score 0.941 (Sensitivity: 0.80; Specificity: 0.94) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000210167 AA Change: V130D PolyPhen 2 Score 0.352 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209294 AA Change: V130D PolyPhen 2 Score 0.352 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209199 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000210978 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000209352 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000210941 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: When challenged, homozygous mutant mice show an increased inflammatory response. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Sigirr |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGAGACACTGCCTTTCCACTGC -3' (R):5'- TCCTGGTGCTCAACTTGACCAATG -3' Sequencing Primer (F):5'- TGCCTCTGAACACCTAGATCC -3' (R):5'- GAGGACTATGGAACCTTCACCTG -3' |
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Posted On | 2013-07-30 |