ID | 67262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rnf26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000053128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ring finger protein 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 8030450I18Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.219) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | T0970 (G3) of strain 713 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 44022078-44024348 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to G at 44023369 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Proline at position 172 (R172P) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000148925 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000034654] [ENSMUST00000056328] [ENSMUST00000065379] [ENSMUST00000114815] [ENSMUST00000114816] [ENSMUST00000114818] [ENSMUST00000185479] [ENSMUST00000162126] [ENSMUST00000206308] [ENSMUST00000206769] [ENSMUST00000205500] [ENSMUST00000206295] [ENSMUST00000114821] [ENSMUST00000161381] [ENSMUST00000152956] [ENSMUST00000215685] [ENSMUST00000216511] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8BUH7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000034654 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000034654 Gene: ENSMUSG00000034739
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000056328 AA Change: R293P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110478 Gene: ENSMUSG00000053128 AA Change: R293P
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000065379 AA Change: R293P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000070060 Gene: ENSMUSG00000053128 AA Change: R293P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114815 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110463 Gene: ENSMUSG00000079592
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114816 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110464 Gene: ENSMUSG00000079592
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114818 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110466 Gene: ENSMUSG00000079592
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000185479 AA Change: R293P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140405 Gene: ENSMUSG00000111409 AA Change: R293P
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000162126 AA Change: R293P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123938 Gene: ENSMUSG00000111409 AA Change: R293P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206308 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206769 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205500 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000181106 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000206295 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174014 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160985 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124568 Gene: ENSMUSG00000053128
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000114821 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000110469 Gene: ENSMUSG00000079592
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161381 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124456 Gene: ENSMUSG00000034739
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152956 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000123040 Gene: ENSMUSG00000079592
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Predicted Effect |
silent Transcript: ENSMUST00000215685 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000216511 AA Change: R172P PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000216960 |
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Meta Mutation Damage Score | 0.0861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | 100% (25/25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] The protein encoded by this intronless gene contains a C3HC5 type of RING finger, a motif known to be involved in protein-DNA and protein-protein interactions. The expression of this gene was found to be upregulated in cancer cell lines derived from different types of cancer. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Rnf26 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GGCAGATAACACACTTCTTCCGCTC -3' (R):5'- ATCTCCAGCAGTGCAGTGGCTATG -3' Sequencing Primer (F):5'- CATGGGTCCTGCCCAGC -3' (R):5'- GGCCATTCTCCTGTGGAC -3' |
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Posted On | 2013-09-03 |