ID | 73814 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Gpc2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029510 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | glypican 2 cerebroglycan | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2410016G05Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01315 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 138271917-138278267 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 138274301 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Serine to Proline at position 354 (S354P) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000124459 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000014089] [ENSMUST00000048028] [ENSMUST00000100530] [ENSMUST00000159067] [ENSMUST00000161827] [ENSMUST00000161984] [ENSMUST00000161279] [ENSMUST00000161665] [ENSMUST00000160729] [ENSMUST00000162245] [ENSMUST00000161647] [ENSMUST00000161691] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q8BKV1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000014089 AA Change: S354P PolyPhen 2 Score 0.005 (Sensitivity: 0.97; Specificity: 0.74) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000014089 Gene: ENSMUSG00000029510 AA Change: S354P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000048028 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000040945 Gene: ENSMUSG00000036928
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000100530 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000098099 Gene: ENSMUSG00000075593
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000159067 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125178 Gene: ENSMUSG00000106247
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159350 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159483 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161827 AA Change: S354P PolyPhen 2 Score 0.005 (Sensitivity: 0.97; Specificity: 0.74) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124459 Gene: ENSMUSG00000029510 AA Change: S354P
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162557 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161055 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000159689 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000161113 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161984 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000137879 Gene: ENSMUSG00000029510
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161279 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124841 Gene: ENSMUSG00000075593
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161665 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124682 Gene: ENSMUSG00000075593
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000160729 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000124170 Gene: ENSMUSG00000036928
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000162245 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125523 Gene: ENSMUSG00000036928
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161647 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125084 Gene: ENSMUSG00000075593
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000161691 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125290 Gene: ENSMUSG00000036928
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000162909 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele are phenotypically normal. [provided by MGI curators] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Gpc2 |
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Posted On | 2013-10-07 |