ID | 82714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Kcnip4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Kv channel interacting protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Calp250, KChIP4a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039035-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R0856 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 48546844-49682249 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice donor site (2 bp from exon) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 48576552 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000134758 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000087395] [ENSMUST00000087395] [ENSMUST00000166924] [ENSMUST00000175660] [ENSMUST00000175660] [ENSMUST00000176191] [ENSMUST00000176191] [ENSMUST00000176978] [ENSMUST00000176978] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q6PHZ8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000087395 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000084656 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000087395 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000084656 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000101214 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000098775 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000101215 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000098776 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000166924 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131276 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000172363 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127538 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000175660 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135799 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000175660 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135799 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000176191 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135071 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000176191 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135071 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000176978 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134758 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000176978 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134758 Gene: ENSMUSG00000029088
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000199818 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176521 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the family of voltage-gated potassium (Kv) channel-interacting proteins (KCNIPs), which belong to the recoverin branch of the EF-hand superfamily. Members of the KCNIP family are small calcium binding proteins. They all have EF-hand-like domains, and differ from each other in the N-terminus. They are integral subunit components of native Kv4 channel complexes. They may regulate A-type currents, and hence neuronal excitability, in response to changes in intracellular calcium. This protein member also interacts with presenilin. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Kcnip4 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- GCACACGGGATTACTCACATGAAACT -3' (R):5'- AGAGAACTTTCTCCTTTCTCCAGACCA -3' Sequencing Primer (F):5'- TACTCACATGAAACTGAGAAATAGGC -3' (R):5'- CTTTCTCCAGACCACACCC -3' |
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Posted On | 2013-11-08 |