ID | 84383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Coro1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | coronin, actin binding protein 1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | coronin 1, Lmb3, Clabp, p57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 126298946-126303925 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 126300701 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Threonine to Alanine at position 168 (T168A) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000146177 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032949] [ENSMUST00000106364] [ENSMUST00000106369] [ENSMUST00000130498] [ENSMUST00000131415] [ENSMUST00000173108] [ENSMUST00000205515] [ENSMUST00000173116] [ENSMUST00000135087] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | O89053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000032949 AA Change: T209A PolyPhen 2 Score 0.002 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.30) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032949 Gene: ENSMUSG00000030707 AA Change: T209A
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000052145 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106364 AA Change: T209A PolyPhen 2 Score 0.002 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.30) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101972 Gene: ENSMUSG00000030707 AA Change: T209A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106369 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101977 Gene: ENSMUSG00000047721
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000123511 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126193 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130498 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114873 Gene: ENSMUSG00000047721
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131415 AA Change: T209A PolyPhen 2 Score 0.000 (Sensitivity: 1.00; Specificity: 0.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117931 Gene: ENSMUSG00000030707 AA Change: T209A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173108 AA Change: T209A PolyPhen 2 Score 0.001 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.15) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134123 Gene: ENSMUSG00000030707 AA Change: T209A
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205515 AA Change: T168A PolyPhen 2 Score 0.005 (Sensitivity: 0.97; Specificity: 0.74) |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144571 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133718 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174579 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140896 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000206275 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173116 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133555 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000135087 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115960 Gene: ENSMUSG00000030707
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: This gene encodes a member of the WD repeat coronin family. The encoded protein may bind actin and interact with microtubules. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014] PHENOTYPE: Mice homozygous for null or hypomorph alleles of this gene display lower peripheral T cell counts resulting from defects in T cell migration and increased rates of apoptosis. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Coro1a |
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Posted On | 2013-11-11 |