ID | 90997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pcolce | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000029718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | procollagen C-endopeptidase enhancer protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Astt-2, Astt2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.099) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01566 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 137603369-137609666 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | utr 3 prime | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 137603422 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000142608 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000031731] [ENSMUST00000037620] [ENSMUST00000054564] [ENSMUST00000111007] [ENSMUST00000124693] [ENSMUST00000197912] [ENSMUST00000154708] [ENSMUST00000133705] [ENSMUST00000142675] [ENSMUST00000155251] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q61398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000031731 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000031731 Gene: ENSMUSG00000029718
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000037620 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000040828 Gene: ENSMUSG00000037221
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000054564 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000057002 Gene: ENSMUSG00000029718
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000111007 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000106636 Gene: ENSMUSG00000037221
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000124693 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120749 Gene: ENSMUSG00000029718
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126904 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128755 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146589 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000148662 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000196366 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137210 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131703 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136649 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198801 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000197912 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142608 Gene: ENSMUSG00000029718
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154708 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000116851 Gene: ENSMUSG00000037221
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000133705 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122462 Gene: ENSMUSG00000037221
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000142675 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115654 Gene: ENSMUSG00000029718
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155251 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000121575 Gene: ENSMUSG00000029718
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] Fibrillar collagen types I-III are synthesized as precursor molecules known as procollagens. These precursors contain amino- and carboxyl-terminal peptide extensions known as N- and C-propeptides, respectively, which are cleaved, upon secretion of procollagen from the cell, to yield the mature triple helical, highly structured fibrils. This gene encodes a glycoprotein which binds and drives the enzymatic cleavage of type I procollagen and heightens C-proteinase activity. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Homozygous mutation of this gene results in thickened cortical and trabecular bone and abnormal collagen fibrils in both mineralized and nonmineralized tissues. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pcolce |
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Posted On | 2013-12-09 |