ID | 91101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tpm1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tropomyosin 1, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TM2, Tpm-1, alpha-TM, Tm3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL01569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 66929872-66956688 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | splice site | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 66938390 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000109337 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000030185] [ENSMUST00000034928] [ENSMUST00000050905] [ENSMUST00000113684] [ENSMUST00000113685] [ENSMUST00000113686] [ENSMUST00000113687] [ENSMUST00000113697] [ENSMUST00000113707] [ENSMUST00000113696] [ENSMUST00000113693] [ENSMUST00000113695] [ENSMUST00000113701] [ENSMUST00000129733] [ENSMUST00000113705] [ENSMUST00000139046] [ENSMUST00000113689] [ENSMUST00000113690] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P58771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000030185 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000030185 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000034928 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000034928 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000050905 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000051888 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113684 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109314 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113685 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109315 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113686 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109316 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113687 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109317 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113697 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109327 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113707 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109337 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113696 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109326 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113693 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109323 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113695 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109325 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113701 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109331 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129733 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000138784 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156899 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113705 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109335 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000139046 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113689 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109319 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000113690 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109320 Gene: ENSMUSG00000032366
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129466 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131279 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | PHENOTYPE: Mice homozygous for disruptions in this gene display embryonic lethality. [provided by MGI curators] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tpm1 |
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Posted On | 2013-12-09 |