ID | 102427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cbarp | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000035640 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | calcium channel, voltage-dependent, beta subunit associated regulatory protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | R29144/1, Dos | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039261-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1189 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 79966268-79976189 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to A at 79967630 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Arginine to Leucine at position 537 (R537L) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000132978 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000003152] [ENSMUST00000105369] [ENSMUST00000105370] [ENSMUST00000105371] [ENSMUST00000123967] [ENSMUST00000169546] [ENSMUST00000170219] [ENSMUST00000147778] [ENSMUST00000132523] [ENSMUST00000213772] [ENSMUST00000152592] [ENSMUST00000144883] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q66L44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000003152 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000003152 Gene: ENSMUSG00000003068
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000105369 AA Change: R530L PolyPhen 2 Score 0.639 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101008 Gene: ENSMUSG00000035640 AA Change: R530L
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105370 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101009 Gene: ENSMUSG00000003068
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000105371 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123967 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000125962 Gene: ENSMUSG00000035640
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128465 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000128488 |
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000169546 AA Change: R537L PolyPhen 2 Score 0.766 (Sensitivity: 0.85; Specificity: 0.92) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000132978 Gene: ENSMUSG00000035640 AA Change: R537L
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000170219 AA Change: R530L PolyPhen 2 Score 0.639 (Sensitivity: 0.87; Specificity: 0.91) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000131487 Gene: ENSMUSG00000035640 AA Change: R530L
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149242 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144108 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146180 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144119 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132317 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000136260 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147778 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000130389 Gene: ENSMUSG00000035640
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000132523 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000128980 Gene: ENSMUSG00000035640
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000213772 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000152592 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118853 Gene: ENSMUSG00000003068
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144883 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114195 Gene: ENSMUSG00000003068
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Cbarp |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CCTTCAGGAGGACAATCAACGCTG -3' (R):5'- AGTCCCTAAAGCACAAACATGTGGC -3' Sequencing Primer (F):5'- TGTCCCCACGGCGTAATG -3' (R):5'- AATGACCGCGACTCAGTG -3' |
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Posted On | 2014-01-15 |