ID | 13071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Pnkd | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000026179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | paroxysmal nonkinesiogenic dyskinesia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2210013N15Rik, 2810403H05Rik, Brp17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.166) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 74324089-74392853 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 74325081 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Lysine to Glutamic Acid at position 50 (K50E) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000109436 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000006462] [ENSMUST00000016309] [ENSMUST00000027370] [ENSMUST00000087226] [ENSMUST00000113796] [ENSMUST00000113805] [ENSMUST00000190008] [ENSMUST00000187046] [ENSMUST00000178235] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q69ZP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000006462 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000006462 Gene: ENSMUSG00000006299
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000016309 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000016309 Gene: ENSMUSG00000006301
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000027370 AA Change: K50E PolyPhen 2 Score 0.528 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000027370 Gene: ENSMUSG00000026179 AA Change: K50E
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Predicted Effect |
possibly damaging Transcript: ENSMUST00000087226 AA Change: K50E PolyPhen 2 Score 0.528 (Sensitivity: 0.88; Specificity: 0.90) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000084478 Gene: ENSMUSG00000026179 AA Change: K50E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000113796 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109427 Gene: ENSMUSG00000006301
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000113805 AA Change: K50E PolyPhen 2 Score 0.995 (Sensitivity: 0.68; Specificity: 0.97) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000109436 Gene: ENSMUSG00000026179 AA Change: K50E
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000128505 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000122874 Gene: ENSMUSG00000006301
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000187908 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135384 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152603 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000129219 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000186833 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000191258 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000192088 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152492 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000138620 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000190008 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140427 Gene: ENSMUSG00000006299
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000187046 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000139411 Gene: ENSMUSG00000006299
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000178235 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000136644 Gene: ENSMUSG00000006299
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene is thought to play a role in the regulation of myofibrillogenesis. Mutations in this gene have been associated with the movement disorder paroxysmal non-kinesigenic dyskinesia. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2010] PHENOTYPE: Mice homozygous for a knock-out allele exhibit decreased levels of the dopamine metabolite 3,4-dihydroxyphenylacetic acid (DOPAC) and lower DOPAC/dopamine ratios after injection of caffeine or ethanol. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Pnkd |
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Posted On | 2012-12-06 |