ID | 13351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdhr4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000032595 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cadherin-related family member 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | D330022A01Rik, 1700021K14Rik, Cdh29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.206) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00539 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 107869696-107876883 bp(+) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 107876744 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Cysteine at position 771 (Y771C) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000135184 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000035214] [ENSMUST00000164395] [ENSMUST00000175759] [ENSMUST00000176373] [ENSMUST00000176306] [ENSMUST00000176356] [ENSMUST00000176854] [ENSMUST00000175874] [ENSMUST00000177173] [ENSMUST00000177508] [ENSMUST00000177368] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | H3BJZ2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000035214 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000035214 Gene: ENSMUSG00000032594
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000035215 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000164395 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000167159 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000175729 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000175759 AA Change: Y208C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135743 Gene: ENSMUSG00000032595 AA Change: Y208C
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000175802 AA Change: Y124C |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135003 Gene: ENSMUSG00000032595 AA Change: Y124C
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000176373 AA Change: Y81C PolyPhen 2 Score 0.974 (Sensitivity: 0.76; Specificity: 0.96) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134896 Gene: ENSMUSG00000032595 AA Change: Y81C
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Predicted Effect |
unknown Transcript: ENSMUST00000176334 AA Change: Y169C |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176454 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176183 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000175891 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177093 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176382 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176919 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000176196 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176306 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176356 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176854 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000141232 Gene: ENSMUSG00000032594
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000176459 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000175874 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135747 Gene: ENSMUSG00000032594
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000177173 AA Change: Y771C PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135184 Gene: ENSMUSG00000032595 AA Change: Y771C
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177226 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000177508 AA Change: Y143C PolyPhen 2 Score 0.998 (Sensitivity: 0.27; Specificity: 0.99) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135332 Gene: ENSMUSG00000032595 AA Change: Y143C
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177516 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000177396 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000177368 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000135553 Gene: ENSMUSG00000079323
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Cdhr4 |
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Posted On | 2012-12-06 |