ID | 14465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Australian Phenomics Network (link to record) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Tlcd1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000019437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | TLC domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610007A15Rik, 0610030G03Rik | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Probably non essential (E-score: 0.148) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | IGL00847 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 78068956-78071646 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to A at 78070914 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Tyrosine to Asparagine at position 168 (Y168N) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000114202 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000017549] [ENSMUST00000092880] [ENSMUST00000098545] [ENSMUST00000102483] [ENSMUST00000127587] [ENSMUST00000148154] [ENSMUST00000147819] [ENSMUST00000108338] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q99JT6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000017549 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000017549 Gene: ENSMUSG00000017405
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000082606 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083742 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000092880 AA Change: Y151N PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000090556 Gene: ENSMUSG00000019437 AA Change: Y151N
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000098545 AA Change: Y168N PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000096145 Gene: ENSMUSG00000019437 AA Change: Y168N
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000102483 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000099541 Gene: ENSMUSG00000058546
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000104437 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000127587 AA Change: Y168N PolyPhen 2 Score 1.000 (Sensitivity: 0.00; Specificity: 1.00) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114202 Gene: ENSMUSG00000019437 AA Change: Y168N
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000131015 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000141578 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000184358 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142812 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144561 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140379 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145507 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127270 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000152611 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000148154 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000127554 Gene: ENSMUSG00000017405
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000147819 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126593 Gene: ENSMUSG00000019437
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108338 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000103975 Gene: ENSMUSG00000019437
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Tlcd1 |
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Posted On | 2012-12-06 |