ID | 150864 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Coro1a | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000030707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | coronin, actin binding protein 1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | coronin 1, Lmb3, Clabp, p57 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039341-MU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1275 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 126298946-126303925 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | critical splice donor site (1 bp from exon) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | C to T at 126299755 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000134123 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000032949] [ENSMUST00000106364] [ENSMUST00000106369] [ENSMUST00000173108] [ENSMUST00000173108] [ENSMUST00000205515] [ENSMUST00000130498] [ENSMUST00000131415] [ENSMUST00000142337] [ENSMUST00000144897] [ENSMUST00000135087] [ENSMUST00000173116] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | O89053 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000032949 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000032949 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000052145 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000084586 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000106364 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101972 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000106369 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000101977 Gene: ENSMUSG00000047721
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000123511 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000126193 |
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000173108 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134123 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
probably null Transcript: ENSMUST00000173108 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134123 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133718 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000174579 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140896 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000206275 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000205515 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000144571 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000155012 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000130498 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000114873 Gene: ENSMUSG00000047721
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000131415 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117931 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000142337 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117927 Gene: ENSMUSG00000059772
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000144897 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118182 Gene: ENSMUSG00000059772
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000135087 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115960 Gene: ENSMUSG00000030707
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000173116 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133555 Gene: ENSMUSG00000030707
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: This gene encodes a member of the WD repeat coronin family. The encoded protein may bind actin and interact with microtubules. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2014] PHENOTYPE: Mice homozygous for null or hypomorph alleles of this gene display lower peripheral T cell counts resulting from defects in T cell migration and increased rates of apoptosis. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Coro1a |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CTCTCCCCATGAGACATTGAGCAC -3' (R):5'- GCCAGGTGACTGACTCCTAATTGAC -3' Sequencing Primer (F):5'- TTGAGCACATCCATGCAGG -3' (R):5'- GTGACTGACTCCTAATTGACTGACC -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |