ID | 151317 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Acadvl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000018574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | acyl-Coenzyme A dehydrogenase, very long chain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | VLCAD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039337-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Possibly essential (E-score: 0.532) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1271 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 69901009-69906237 bp(-) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to G at 69905526 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Serine to Proline at position 71 (S71P) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000099634 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000018718] [ENSMUST00000019362] [ENSMUST00000102574] [ENSMUST00000102575] [ENSMUST00000108588] [ENSMUST00000123687] [ENSMUST00000231415] [ENSMUST00000133140] [ENSMUST00000134376] [ENSMUST00000231221] [ENSMUST00000232002] [ENSMUST00000190940] [ENSMUST00000108589] [ENSMUST00000231506] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P50544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000018718 AA Change: S49P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000018718 Gene: ENSMUSG00000018574 AA Change: S49P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000019362 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000019362 Gene: ENSMUSG00000020888
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000083600 |
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Predicted Effect |
probably damaging Transcript: ENSMUST00000102574 AA Change: S71P PolyPhen 2 Score 0.997 (Sensitivity: 0.41; Specificity: 0.98) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000099634 Gene: ENSMUSG00000018574 AA Change: S71P
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000102575 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000099635 Gene: ENSMUSG00000020888
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000108586 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108588 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104229 Gene: ENSMUSG00000020886
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137187 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000146129 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000156733 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000145478 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134516 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000123687 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000134545 Gene: ENSMUSG00000020886
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231415 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000133140 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000126707 Gene: ENSMUSG00000020886
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000134376 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115206 Gene: ENSMUSG00000020886
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231221 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000232002 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000190940 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000140073 Gene: ENSMUSG00000020888
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000108589 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000104230 Gene: ENSMUSG00000020886
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000231506 |
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: This gene encodes a homodimeric mitochondrial flavoprotein and is a member of the acyl-CoA dehydrogenase family. Members of this family catalyze the first step of fatty acid beta-oxidation, forming a C2-C3 trans-double bond in a FAD-dependent reaction. As beta-oxidation cycles through its four steps, each member of the acyl-CoA dehydrogenase family works at an optimum fatty acid chain-length. This enzyme has its optimum length between C16- and C20-acylCoA and localizes to the inner mitochondrial membrane (unlike related acyl-CoA dehydrogenases). In mice, deficiency of this gene can cause ventricular arrhythmias as well as fasting and cold intolerance. [provided by RefSeq, Nov 2012] PHENOTYPE: Homozygous mutant animals exhibit mild steatosis, lipid accumulation in myocytes, increased fatigue, impaired temperature regulation, increased susceptibility to arrhythmia, accumulation of long-chain acylcarnitines, and lower free carnitine levels. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Acadvl |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- CACCAGCTCTTTGAGAAATTGTGCC -3' (R):5'- GCGCTTCCTGCACACCTTTTAAGAC -3' Sequencing Primer (F):5'- GAGAAATTGTGCCTGTTCTTCAC -3' (R):5'- TGCACACCTTTTAAGACCCATC -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |