ID | 152170 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Sox15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000041287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SRY (sex determining region Y)-box 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sox16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MMRRC Submission | 039314-MU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Non essential (E-score: 0.000) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1247 (G1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 69546140-69547553 bp(+) (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | T to C at 69547320 bp (GRCm39) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Phenylalanine to Serine at position 190 (F190S) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000048524 (fasta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000018905] [ENSMUST00000018909] [ENSMUST00000047373] [ENSMUST00000148242] [ENSMUST00000155200] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | P43267 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000018905 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000018905 Gene: ENSMUSG00000018761
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000018909 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000018909 Gene: ENSMUSG00000018765
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000047373 AA Change: F190S PolyPhen 2 Score 0.331 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000048524 Gene: ENSMUSG00000041287 AA Change: F190S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000125389 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000129025 Gene: ENSMUSG00000018761
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125586 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127118 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000129224 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000120001 Gene: ENSMUSG00000018761
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000132742 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000149764 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000153217 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000137288 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000139155 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000148242 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000133074 Gene: ENSMUSG00000018761
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155200 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000117715 Gene: ENSMUSG00000018761
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype |
FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a member of the SOX (SRY-related HMG-box) family of transcription factors involved in the regulation of embryonic development and in the determination of the cell fate. The encoded protein may act as a transcriptional regulator after forming a protein complex with other proteins. [provided by RefSeq, Jul 2008] PHENOTYPE: Mice homozygous for disruptions in this gene display abnormalities in muscle fiber differentiation and in muscle regeneration after injury. [provided by MGI curators] |
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Allele List at MGI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Sox15 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TCTAACCCTGTCTGCTGCAAACTG -3' (R):5'- TCCTTTTGGACCAAGGACAGAGCC -3' Sequencing Primer (F):5'- TGGTCAGACCAGTCCCC -3' (R):5'- TTGCTGCTGTAGGGAGAGAATAC -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |