ID | 152341 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Institutional Source | Beutler Lab | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Exosc8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000027752 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310032N20Rik | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Numbers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Essential gene? | Essential (E-score: 1.000) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stock # | R1233 (G1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Quality Score | 225 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Not validated | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosome | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chromosomal Location | 54636099-54642469 bp(-) (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type of Mutation | missense | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DNA Base Change (assembly) | A to T at 54639419 bp (GRCm39) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zygosity | Heterozygous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino Acid Change | Cysteine to Serine at position 129 (C129S) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ref Sequence | ENSEMBL: ENSMUSP00000118780 (fasta) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model | predicted gene model for transcript(s): [ENSMUST00000029315] [ENSMUST00000029316] [ENSMUST00000044567] [ENSMUST00000153224] [ENSMUST00000155273] [ENSMUST00000200439] [ENSMUST00000197502] [ENSMUST00000141191] [ENSMUST00000154787] [ENSMUST00000199674] [ENSMUST00000200441] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
AlphaFold | Q9D753 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029315 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029315 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000029316 AA Change: C125S PolyPhen 2 Score 0.001 (Sensitivity: 0.99; Specificity: 0.15) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000029316 Gene: ENSMUSG00000027752 AA Change: C125S
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000044567 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000035879 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000125632 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000127112 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000134892 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000135935 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000153224 AA Change: C129S PolyPhen 2 Score 0.304 (Sensitivity: 0.90; Specificity: 0.89) |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118780 Gene: ENSMUSG00000027752 AA Change: C129S
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000143387 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000198780 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000140935 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000142377 |
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Predicted Effect |
noncoding transcript Transcript: ENSMUST00000150923 |
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000155273 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000119260 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200439 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143059 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000197502 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143750 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000141191 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000118818 Gene: ENSMUSG00000036632
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000154787 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000115876 Gene: ENSMUSG00000027752
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000199674 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000142948 Gene: ENSMUSG00000027751
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Predicted Effect |
probably benign Transcript: ENSMUST00000200441 |
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SMART Domains |
Protein: ENSMUSP00000143231 Gene: ENSMUSG00000027751
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Coding Region Coverage |
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Validation Efficiency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Phenotype | FUNCTION: [Summary is not available for the mouse gene. This summary is for the human ortholog.] This gene encodes a 3'-5' exoribonuclease that specifically interacts with mRNAs containing AU-rich elements. The encoded protein is part of the exosome complex that is important for the degradation of numerous RNA species. A pseudogene of this gene is found on chromosome 6. [provided by RefSeq, Mar 2009] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele List at MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other mutations in this stock |
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Other mutations in Exosc8 |
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Predicted Primers |
PCR Primer (F):5'- TGCTGCTACGTTAGCCAGTGAAAG -3' (R):5'- GAGGCTCAAGTAACCAGCCAGTTC -3' Sequencing Primer (F):5'- gatacagaaggaggagggaaag -3' (R):5'- CAGCCAGTTCATTGCAGATG -3' |
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Posted On | 2014-01-29 |